高校1年生の海賊王（ルフィ）と菜美（なみ）は二人ともワンピースのキャラクターの名前ということもあり、距離を縮めていた。しかし、そこにワンピースネームを持つもう１人の同級(jí)生、噓風(fēng)（ウソップ）が現(xiàn)れたことで、穏やかな日常が崩されてしまう。噓風(fēng)は海賊王と菜美を巻き込んで「海賊部」を結(jié)成し、船員を集めていく。こうして〝ひとつなぎの大秘寶?を目指す、ドタバタな學(xué)園生活が幕を開けるーー！